انمي Shin Taketori Monogatari: 1000-nen Joou (قصة تاكيتوري الجديدة: ملكة الألف عام)، العام هو 1999. أماموري هاجيمي مجرد طالب عادي في المرحلة الابتدائية، يحاول الدراسة ويقضي وقته مع أصدقائه المجانين. ولكن في أحد الأيام، بينما كان والده يختبر جهازًا كان يعمل عليه، حدث شيء تسبب في انفجاره، مما أدى إلى تدمير المنزل بالكامل! والآن، بعد أن أصبح يتيمًا، يتم أخذه للعيش مع عمه الذي يعمل كعالم فلك.
في مرصد عمه، يلتقي هاجيمي بفتاة رآها من قبل وأُعجب بها قليلاً. يكتشف أن اسمها يوكينو ياي، وأن والديها يديران مطعم رامن في المدينة. ولكن الأفضل من ذلك، أنها تعمل كمساعدة لعمه! يا له من حظ!
لكن ياي ليست كما تبدو تمامًا. هناك سبب يجعلها تساعد أماموري-سان في المرصد. إنها ملكة الألفية (سين-نين جوو)، التي اختارها كوكبها الأم لا ميتال خصيصًا للذهاب إلى الأرض والمساعدة في التحضير لاحتمال فناء الكوكب. ما الذي سيتسبب في هذه الكارثة؟
يملك لا ميتال مدارًا بيضاويًا للغاية يجعله يقترب جدًا من الأرض كل 1000 عام. عندما يقترب بما يكفي، يتسبب ذلك في تفاعلات على الأرض، مما يؤدي إلى جميع أنواع الكوارث الطبيعية. وعلى الرغم من اختيارها بهدف حماية لا ميتال، فإن خطتها الشخصية هي إجلاء أكبر عدد ممكن من البشر إلى لا ميتال، حتى إذا دُمِّر كوكبهم، يمكنهم النجاة.
ومع ذلك، هناك شخص يسعى جاهدًا لإيقاف خطتها، وهو زعيم لصوص الألفية. لماذا يريد إيقاف ياي؟ وكيف يعرف عن ملكة الألفية في المقام الأول؟