انمي No.6 (الرقم ستة)، منذ عدة سنوات، بعد نهاية حرب عالمية دموية، لجأ الجنس البشري إلى ست دول مدن كانت سلمية ومثالية... على الأقل ظاهريا. ومع ذلك، اكتسب شيون- وهو من النخبة المقيمة في الدولة المدينة رقم 6- منظورا جديدا للعالم الذي يعيش فيه، وذلك بفضل لقاء صدفة مع صبي غامض، نزومي . تبين أن "نيزومي" مجرد واحد من كثير ممن عاشوا في أرض مقفرة خلف جدران المدينة الفاضلة المفترضة. ولكن على الرغم من علمه أن الصبي الآخر كان هاربا، قرر شيون أن يأخذه ليلا ويحميه، مما أدى إلى عواقب وخيمة: بسبب أفعاله، فقد شيون ووالدته مكانتهما كنخبة وتم نقلهما إلى مكان آخر، وبدأ الجانب المظلم من المدينة في الكشف عن نفسه.
الآن، بعد وقت طويل من لقائهما الأول الذي غير حياته، اجتمع شيون ونيزومي أخيرا معا مرة أخرى- فالنخبة السابقة والصبي الهارب على وشك الشروع في مغامرة ستكشف، في الوقت المناسب، الأسرار المحطمة ل رقم 6.
